Acest program de studii masterale funcţionează începând din anul 2003 şi are ca obiectiv primordial pregătirea unor specialişti capabili de o abordare complexă şi completă a problemelor care vizează:

• biotehnologiile de obţinere a substanţelor biologic active;
• utilizarea potenţialului microorganismelor în scopul bioremedierii calităţii solurilor, aerului, apelor şi de biodegradare a xenobioticelor;
• utilizarea deşeurilor agricole, industriale şi menajere în vederea obţinerii biomasei şi produselor secundare ale metabolismului microbian;
• tehnologiile de producere a biocombustibilului;
• utilizarea tehnologiilor avansate cu implementare în zootehnie, acvacultură şi apicultură;
• tehnologiile de obţinere a unor biofertilizatori utilizaţi pentru creşterea producţiilor agricole;
• implementarea unor noi metode de monitorizare a calităţii aerului, apei şi solului prin biotehnologii moleculare.

Tematica lucrărilor de disertaţie reprezintă un studiu al impactului biotehnologiilor microbiene şi celulare asupra dezvoltării diferitelor ramuri industriale, agricole, medicale, etc.   

O atenţie deosebită se acordă pregătirii masteranzilor pentru cercetarea ştiinţifică prin asigurarea următoarelor căi:

atragerea masteranzilor pasionaţi de anumite domenii ale biotehnologiei prin activităţile de cercetare propriu-zisă, pe lângă cadrele didactice, la realizarea unor teme de cercetare individuale sau colective, a unor granturi, a unor contracte cu beneficiari economici etc.;

stimularea studenţilor cercetători pentru a participa la sesiuni ştiinţifice studenţeşti sau altemanifestări naţionale şi internaţionale.